obiecte
abstract
Modificările numărului de copii genomice (CNV) sunt puternic implicate ca factori genetici importanți pentru obezitate. Un studiu recent de asociere a genomului a identificat o nouă variantă a rs12444979, care se află într-un dezechilibru ridicat de legare cu CNV 16p12.3, pentru asocierea cu obezitatea la europeni. Scopul acestui studiu a fost de a examina direct relația dintre CNV 16p12.3 și fenotipurile obezității, inclusiv indicele de masă corporală (IMC) și grăsimea corporală.
Subiecții au fost un eșantion multi-etnic, incluzând 2286 subiecți fără legătură din populația europeană și 1627 subiecți Han fără legătură din populația chineză. Greutatea grăsimii corporale a fost măsurată prin absorbție dublă cu raze X.
rezultatele:
Folosind Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0, am detectat direct CNV 16p12.3 cu o frecvență de ștergere de 27, 26 resp. 0,8% la populațiile europene și chineze. Am confirmat o asociere semnificativă între acest CNV și obezitate (IMC: P = 1, 38 × 10 -2; masă de grăsime corporală: P = 2, 13 × 10 −3) la populația europeană. Numărul mai mic de copii a fost asociat cu IMC mai mic și greutatea grăsimii corporale, iar magnitudinea efectului a fost estimată la 0,62 (IMC) și 1,41 (greutatea grăsimii corporale). Cu toate acestea, nu am observat un semnal de asociere semnificativ pentru populația chineză, iar frecvențele acestei ștergeri CNV sunt destul de diferite între populațiile europene și chineze (P 1, 2). Moștenirea a fost estimată la 40-70% 3, 4 Masa corporală Indicele (IMC) este fenotipul cel mai utilizat pentru a evalua obezitatea datorită ușurinței de măsurare. Pe lângă IMC, masa de grăsime corporală poate fi utilizată și ca fenotip complementar pentru a caracteriza obezitatea. Determinanții acestor fenotipuri ar putea duce la o mai bună înțelegere a patogeneza obezității.
Rezultatul
Tabel în dimensiune completă
Tabel în dimensiune completă
Diferențe de fenotip pentru CNV 16p12.3 în eșantionul european.
Imagine la dimensiune completă
Pentru eșantionul chinez, am constatat că frecvența acestei ștergeri CNV a fost diferită de frecvența din eșantionul european (testul P 2). Am găsit doar 13 persoane (0,8%) cu o deleție heterozigotă. Majoritatea subiecților au fost de tip sălbatic, cu două numere de copii (99,2%). Nu am găsit o asociere semnificativă între acest CNV și IMC și greutatea grăsimii corporale (Tabelul 2). Pentru marcarea SNP rs12444979, nu există polimorfism în proba chineză.
discuţie
Un GWAS recent la scară largă a identificat o nouă variantă, rs12444979, care se află într-un dezechilibru mare de legare cu CNV 16p12.3, pentru asocierea cu obezitatea. 18 Alela de ștergere a fost desemnată alela T rs12444979 cu o frecvență de alelă de 0, 13. Acest studiu a furnizat dovezi indirecte pentru o asociere între CNV 16p12.3 și obezitate, deoarece identificarea CNV s-a bazat pe etichetarea SNP. În studiul nostru, am detectat cu succes CNV 16p12.3 folosind Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0, care este conceput pentru a detecta CNV comune și a confirmat direct o asociere semnificativă între acest fenotip CNV și obezitate la populația europeană. Rezultatele noastre au demonstrat validitatea constatărilor inițiale și au susținut în continuare contribuția potențială a CNV 16p12.3 la patogeneza obezității.