afganistan

  • obiecte
  • abstract
  • introducere
  • Rezultatul
  • Distribuția haplogrupurilor de cromozomi Y
  • Relațiile populației
  • Previziuni de rețea și estimări de timp
  • discuţie
  • Impactul Asiei Centrale de Sud în Afganistan
  • Asemănarea dintre Patanii din Afganistan și Pakistan
  • Despre originea patanilor
  • concluzie
  • Informatii suplimentare
  • Fișiere imagine
  • Figura suplimentară 1a
  • Figura suplimentară 1b
  • Figura suplimentară 2a
  • Figura suplimentară 2b
  • Figura 3 suplimentară
  • Figura suplimentară 4a
  • Figura suplimentară 4b
  • Documente Word
  • Legende de imagine suplimentare
  • Tabel suplimentar 1
  • Tabelul suplimentar 2
  • Tabelul suplimentar 3
  • Tabelul suplimentar 4
  • Fișiere Excel
  • Tabelul suplimentar 5

Video: Rory Stewart: E timpul să încheiem războiul din Afganistan (februarie 2021)

obiecte

abstract

Localizarea geografică a populațiilor analizate pentru CA, ML și AMOVA. Pentru o descriere a populației, consultați referințele din Tabelul 1.

Imagine la dimensiune completă

Limbile oficiale din Afganistan, dari și paștoase, sunt de origine indo-europeană și sunt vorbite de tadjici și patani sau pașteni. Patanii trăiesc în principal la sud de Munții Hindu Kush și formează cel mai răspândit grup etnic din Afganistan (42%), reprezentând aproximativ 15% din populația din Pakistanul vecin. Deși au fost sugerate diverse origini pentru patani, inclusiv origini grecești și evreiești, 3, 4 aceste asociații nu au fost demonstrate și doar câteva studii care caracterizează structura genetică a acestui grup în Pakistan, 5, 6, 7, 8, 9 Afganistan . 10 și India 11 au fost publicate.

Datorită cantității limitate de date genetice disponibile, acest studiu a fost realizat pentru a determina, pentru prima dată, diversitatea genetică a patanilor din Afganistan utilizând markeri binar de înaltă rezoluție pentru cromozomii Y. Datele obținute au fost apoi comparate cu populațiile lumii orientate geografic și etnic publicate anterior pentru a examina semnalele paterne ale dispersiei oamenilor moderni din Asia Centrală. În plus, am evaluat afinitățile genetice dintre Pathans din Afganistan și Pathans din Pakistanul vecin, precum și relația lor filogenetică presupusă cu populațiile grecești și evreiești.

Rezultatul

Distribuția haplogrupurilor de cromozomi Y

Dintr-un total de 116 markeri binari tipizați, am identificat 25 de linii paterne la 190 de bărbați afgani, dintre care 11 au fost observați în nordul Afganistanului și 22 în colecția sudică (Figura 2), indicând un grad relativ mai mare de diversitate genetică în regiunea sudică . Munții Hindu Kush orientați spre nord. Cu toate acestea, această constatare ar trebui atenuată, având în vedere diferența de mărime a eșantionului dintre cele două colecții. În ansamblu, numai haplogrupurile R1a1a * -M198 (62,1%), L3 * -M357 (7,4%) și G2c-M377 (5,3%) prezintă frecvențe> 5% și împreună reprezintă aproape trei sferturi din fondul genetic al tatălui afgan.

Majoritatea indivizilor afgani examinați în cadrul anchetei actuale aparțin haplogrupului R-M207 (67,4%), subhaplogrupul R1a1a * -M198 predominând atât în ​​colecțiile nordice (50%), cât și în cele sudice (65,8%) (Figura 2). reflectat și în hărțile de contur R1a1a-M198 (figura suplimentară 1a) și R1a1a * -M198 (figura suplimentară 1b). Este interesant de observat că ramura paralaxă a R2a-M124 este observată într-un raport semnificativ mai mare în nordul Afganistanului (11,4%) comparativ cu sudul (2,1%) și că haplogrupurile R2 * -M479 (0,7%) și R1b1a2a L23 (0,7%) este detectat, deși la frecvențe joase, exclusiv în regiunea sudică a țării.

Haplogrupul L-M20 (9,5%), al doilea cel mai abundent din acest studiu, prezintă diferențe semnificative în distribuția pe ambele părți ale Hindu Kush, cu 25% din nordul Afganistanului comparativ cu doar 4,8% dintre bărbații din sud. Mai exact, paragrupul L3 * -M357 reprezintă cea mai mare parte a cromozomilor L-M20 atât în ​​colecțiile nordice (20,5%), cât și în cele sudice (4,1%), după cum reiese din hărțile de contur furnizate în figurile suplimentare 2a (L-M20) și 2b . (L3-M357) în Afganistan și regiunile înconjurătoare.

Haplogrupul G-M201, care apare la o frecvență medie de 7,9% în grupul de gene afgane, este raportat la frecvențe înalte în Caucaz (de exemplu, 74% în osetii Digora) 32 și se crede că este asociat cu expansiunea neolitică. . în toată regiunea. 33 Deși G2c-M377 este al doilea cel mai frecvent haplogrup din sudul Afganistanului (6,2%), este semnificativ mai mic în populația din nord (2,3%). Cu excepția subzonei G2a * -P15, care a fost observată în nord (2,3%) și în sud (1,4%), restul derivatelor G (G2a1 * -P16 (0,7%) și G * -M201 ( 0, 7%)) se găsesc exclusiv în provinciile sudice. În mod similar, haplogrupurile C-M216 (3,4%) și Hla * -M82 (4,1%) sunt limitate la indivizi din sud. Alte haplogrupuri informative care sunt împărțite între nord și sud includ J-M304 și Q-M242. În nord, haplogrupurile de mai sus sunt definite de mutațiile J2a * -M410 (2,3%), J2a3-M68 (2,3%) și Q1a3 * -M346 (4,5%). În contrast, afganii din sud sunt caracterizați prin cinci subgrupuri din haplogrupul J-M304 (adică J1 * -M267, J2a * -M410, J2a5-M158, J2b1-M205 și J2b2-M241) împreună cu frecvența

( A ) CA construită utilizând software-ul NTSYSpc 2.02i (Applied Biostatistics Inc., Setauket, NY, SUA) și bazat pe haplogrupuri cu cromozomi Y. Abrevierile pentru populație sunt date în Tabelul 1. ( b ) Grafic MDS bazat pe primele distanțe ale haplotipului de frecvențe R1a1a-M198 de haslotipuri de probe de patani, evrei askenazi, greci, indieni și pakistanezi. Pentru analiza MDS Stres = 0, 06142. Codurile populației sunt: ​​NAFG = Patani din nordul Afganistanului, SAFG = Patani din sudul Afganistanului, PTHP = Patani din Pakistan, RUS = ruși (sudul Rusiei centrale, sud-vestul Rusiei, nord-vestul Rusiei și Rusia Uralică), GRE = greci, ASH = evrei askenazi, IND = India și PAK = Pakistan. Populațiile utilizate în analiză sunt listate în tabelul suplimentar 1.

Imagine la dimensiune completă

Tabel în dimensiune completă

Un grafic MDS bazat pe haplotipurile R1a1a-M198 (Figura 3b) a fost efectuat pentru a examina afinitățile genetice dintre Patanii din Afganistan și Pakistan, în plus față de alte câteva populații de referință relevante (Tabelul suplimentar 1). În Figura 3b, Patanii din Afganistan și Pakistan sunt conspirați unul lângă celălalt în cadranul din dreapta jos, în timp ce populațiile din India, Pakistan și Rusia se adună liber în colțul din dreapta sus al graficului. În contrast, colecția evreiască a lui Ashkenazi se află în cadranul stânga sus, care este departe de toate celelalte populații incluse în analiză.

Previziuni de rețea și estimări de timp

Figura 4a prezintă o rețea MJ bazată pe profilul Y-STR 8-locus al indivizilor R1a1a * -M198 din diferite regiuni din Eurasia. Cel mai abundent haplotip (DYS 19 * 16, DYS 389I * 13, DYS 389II * 17, DYS 390 * 24, DYS 391 * 11, DYS 392 * 11, DYS 393 * 13 și DYS439 * 10) a fost observat în 5 (11, 3)%) de indivizi din nordul Afganistanului și 35 (24%) de afgani din colecția sudică. În schimb, apare al doilea cel mai frecvent haplotip (DYS 19 * 16, DYS 389I * 13, DYS 389II * 17, DYS 390 * 25, DYS 391 * 11, DYS 392 * 11, DYS 393 * 13 și DYS 439 * 10) în nordul Afganistanului (6, 8%) comparativ cu colecția sudică (4, 8%) și are loc și între Rusia, Ucraina, Slovacia și Turcia. Interesant este că al treilea cel mai frecvent haplotip (DYS 19 * 16, DYS 389I * 13, DYS 389II * 17, DYS 390 * 25, DYS 391 * 10, DYS 392 * 11 și DYS 393 * 13) în proiecția R1a1a-M198 ( Figura suplimentară 4a) este împărtășită în principal evreilor askenazi din Europa de Vest și de Est (4,1%) și sudul Afganistanului (3,4%), dar este absentă de la indivizii din nordul Afganistanului.

A ) Proiecția în rețea a populațiilor analizate pentru R1a1a * -M198 la o rezoluție de opt loci: DYS 389I, DYS 389II, DYS 390, DYS 391, DYS 392, DYS 393, DYS 19 și DYS 439. b ) Proiecția rețelei de populații analizate pentru L-M20 la o rezoluție de opt loci: DYS 389I, DYS 389II, DYS 390, DYS 391, DYS 392, DYS 393, DYS 19 și DYS 439. Populațiile utilizate pentru analiză sunt enumerate în tabelul suplimentar 1.,

Imagine la dimensiune completă

În Figura 4b, cel mai abundent haplotip (DYS 19 * 14, DYS 389I * 12, DYS 389II * 16, DYS 390 * 22, DYS 391 * 10, DYS 392 * 14, DYS 393 * 11 și DYS 439 * 13) indivizii examinați L-M 2 O constau din 7 (2,3%) probe din sudul Indiei și 12 (13,2%) din sudul Pakistanului. Doar un individ (2, 3%) din nordul Afganistanului împărtășește acest haplotip. Un alt haplotip predominant L-M20 (DYS 19 * 14, DYS 389I * 12, DYS 389II * 16, DYS 390 * 22, DYS 391 * 10, DYS 392 * 14, DYS 393 * 11 și DYS 439 * 12) este partajat exclusiv între 12 (4, 0%) indivizi din sudul Indiei și 3 (3, 3%) din sudul Pakistanului. Analiza rețelei bazată pe L3-M357 nu a fost informativă din cauza numărului limitat de indivizi și populații disponibile pentru comparație (Figura suplimentară 4b).

Tabelul suplimentar 5 oferă estimări ale timpului de coalescență pe baza diversității Y-STR, precum și a variantelor de haplotip asociate haplotipurilor L-M20, L3-M357, R1a1a-M198 și R1a1a * -M198 în Afganistan și alte populații de referință. În plus, am efectuat calcule de timp și varianță ale variantelor de haplotip pentru L3 * -M357 pentru populațiile studiate din nordul și sudul Afganistanului. Pentru R1a1a-M198, estimările timpului evolutiv se bazează pe șapte loci Y-STR pentru populațiile din Afganistan de 7, 8 ± 2, 2 kya. Cele mai vechi date pentru acest haplogrup sunt observate în Pakistan (19, 1 ± 2, 9 kya) și India (17, 9 ± 3, 7 kya). Estimările de timp pentru Haplogroup L-M20 în nord (14, 6 ± 7, 3 kya) și în sud (17, 8 ± 8, 4 kya) Afganistanul sunt mai noi decât în ​​Pakistan (26, 3 ± 5, 3 kya ). Când se iau în considerare L3-M357 și Ra1a1 * -M198, același model de vârstă relativă este observat la populațiile de mai sus, cu date mai vechi găsite în Pakistan și subcontinentul indian.

discuţie

Deși ambele populații afgane sunt caracterizate predominant de liniile R1a1a * -M198, ambele diferă prin distribuția restului de haplogrupuri. Sudul Afganistanului reprezintă 22 de markeri binari polimorfi, dintre care 14 lipsesc în regiunea de nord (Figura 2), indicând o diversitate genetică redusă la această populație. O posibilă explicație pentru diversitatea redusă poate fi prezența Muntelui Hindu Kush, care ar fi putut servi ca o barieră direcțională pentru fluxul genetic.

Impactul Asiei Centrale de Sud în Afganistan

Pe de altă parte, se presupune că Haplogroup L-M20 ar fi provenit din India sau Orientul Mijlociu 37 de aproximativ 30 kya. Acest indicator, situat la 25% în nordul Afganistanului și 4,8% în sud, a fost raportat anterior cu frecvență ridicată (48%) în comunitatea Kallar din sudul Indiei 33, precum și în cealaltă populație (35%). din Israel. 38 Estimările de timp generate pe baza celor șapte loci Y-STR din liniile L-M20 pentru populațiile nordice (14, 6 ± 7, 3 kya) și sudice (17, 8 ± 8, 4 kya) din Afganistan sunt la fel de medii ca populațiile din Pakistan (26, 3 ± 5, 3 kya) și India (7, 5) ± 1, 7 kya) (Tabelul suplimentar 5). Pakistanul mai arată o dispersie mai mare a haplotipurilor (0, 548) decât India (0, 118), sugerând că L-M20 provine probabil în Pakistanul actual, mai degrabă decât în ​​India. În plus, estimările timpului de dezvoltare (tabelul suplimentar 5) generate pentru liniile L3-M357 la combinarea populațiilor din nordul și sudul Afganistanului (11, 4 ± 5, 0 kya) sunt comparabile cu estimările calculate pentru Pakistan (10, 8 ± 3, 8 kya) și mai mare decât India (5, 2 ±) 2, 4 kya) într-o rezoluție de șapte loci. Această constatare susține opinia conform căreia sub-fosa L3-M357 este de origine afgană sau pakistaneză și se extinde ulterior spre sud, în India.

Asemănarea dintre Patanii din Afganistan și Pakistan

Studiul nostru demonstrează legăturile genetice strânse dintre Patanii din Afganistan și Pakistan. Relația dintre patanii din cele două regiuni este de așteptat să ia în considerare faptul că linia Durand, care a stabilit frontiera sud-estică a Afganistanului din 1893, a fost impusă fără griji tribului și etniei. Analiza CA (Figura 3a) și ML (Figura 3 suplimentară) susține această asemănare genetică, deoarece clusterul atât în ​​nordul, cât și în sudul Afganistanului se află aproape de Pakistan. Includerea de date suplimentare haplotip de la 41 Pathans care trăiesc în Peshawar, nord-vestul Pakistanului 5 (disponibil în baza de date YHRD) sugerează că cel mai abundent haplotip cu șapte locus (29,3%) este identic cu haplotipul nostru modal, confirmând asemănările genetice dintre căi din Afganistan și Pakistan. Această relație filogenetică este evidentă în mod similar în graficul MDS (Figura 3b), unde toate cele trei populații Pathan sunt apropiate. De asemenea, în proiecția rețelei R1a1a-M198 (Figura suplimentară 4a), aceste populații împart haplotipuri diferite. Prezența haplogrupurilor L3-M357 și Q1a3-M346 în ambele patane din Afganistan și Pakistan 8, 9 promovează în continuare relațiile genetice dintre patanele din aceste două regiuni.

Despre originea patanilor

7%), 42 este identic cu ipoteza de mai sus.

concluzie