Laboratorul genetic se ocupă cu diagnosticul genetic prenatal, diagnosticul bolilor ereditare și diagnosticul genetic asociat bolilor oncologice.
În domeniul diagnosticului genetic oncologic efectuăm analize genetice ale variantelor somatice în diagnostice oncologice (oncohematologie, cancer colorectal, screening cancer cancer de col uterin) și în domeniul diagnosticelor non-oncologice ne ocupăm de diagnosticarea și prevenirea bolilor care au o bază ereditară, inclusiv diagnosticarea genetică prenatală.
Examinări oncogenetice sunt indicați de specialiști din domeniile oncologiei pentru a determina diagnosticul, monitoriza starea tratamentului și detectarea precoce a debutului recăderii la pacienții cu cancer.
Suntem un loc de muncă specializat axat pe o gamă largă de examinări oncogenetice și neoncogenetice - cea mai largă de pe piața actuală. Pe multe dintre ele le desfășurăm ca singurul loc de muncă din Slovacia sau Europa Centrală. Testele sunt alese pentru a conduce nu numai la diagnostic prenatal, diagnosticul tulburărilor de fertilitate, dar a devenit și baza pentru tratamentul și monitorizarea pacienților cu cancer după tratament. Scopul nostru este de a oferi clienților un diagnostic genetic cuprinzător al infertilității masculine și feminine, care duce la tratamentul personalizat al acestuia în funcție de echipamentul genetic și de nevoile unui anumit cuplu.
Secvențierea NGS în oncodiagnostic
Secvențierea noii generații de NGS înlocuiește în prezent tehnicile clasice de biologie moleculară pentru detectarea mutațiilor cauzale în tumori. Principalele avantaje ale NGS sunt testarea simultană a zeci de gene, într-un timp mult mai scurt. Tehnologia NGS este un instrument important pentru screeningul cancerului la persoanele cu risc crescut. Potențialul secvențierii genei panoului NGS în oncodiagnostic poate fi utilizat pentru diagnostic rapid, monitorizare preventivă a pacienților, terapie personalizată și profilaxie chirurgicală.
Motive pentru teste genetice non-oncologice sunt: malformații congenitale sau boli cu familie moștenită, infertilitate - depistarea cauzelor tulburărilor de fertilitate, avorturi spontane repetate, naștere mortală, sarcină planificată după tratament oncologic, relație de familie, sarcină (vârsta mamelor peste 35 de ani, rezultat pozitiv al ultrasunetelor sau examenului biochimic, riscul de tulburări moștenite recurente în familie, expunerea la influențe externe - medicamente, radiații ionizante și boli infecțioase) și altele. Oferim examinare clinico-genetică: analiza istoricului personal și familial al ambilor parteneri din cadrul consultarea genetică în clinica noastră genetică.
Astăzi este o parte integrantă diagnostic genetic prenatal de asemenea, screeningul pentru bolile determinate genetic, cu un grup specific în screeningul prenatal testare prenatală neinvazivă (NIPT). Medirex este lider regional în domeniul NIPT prin propriile teste cunoscute sub numele de Test TRISOMY din 2015. În prezent este posibil să se aleagă în portofoliul testelor TRISOMY de bază (Test TRISOMY A Test TRISOMY XY), precum și avansat (Test TRISOMY + A Test TRISOMY Finalizat) tipuri de teste care diferă în ceea ce privește amploarea tulburărilor cromozomiale examinate. Cele mai cunoscute tulburări, deja cercetate în testul de bază TRISOMY, sunt trisomia cromozomilor 21, 18 și 13 (cauzând sindromul Down, Edwards și Patau). Pe de altă parte, cel mai extins tip de test Testul TRISOMY Complete oferă o scanare completă a genomului (conform specificațiilor tehnice și în ceea ce privește limitările testului), în care sunt examinate zeci de anomalii cromozomiale cunoscute care cauzează sindroame clinice mai mult sau mai puțin cunoscute.
În laboratorul genetic, examinările se efectuează la trei niveluri - citogenetica, hibridizare fluorescentă in situ A diagnostic molecular. Am stabilit o gamă largă de examene, pe care le folosim pentru a determina diagnosticul exact al pacientului. Departamentul de Genetică Clinică din Bratislava implementează testări genetice de ultimă generație folosind secvențieri NGS de nouă generație începând din 2018, care permit examinarea în grup a genelor, exomului clinic sau întregului exom.
Oferim diagnostice genetice complete pentru pacienți
Metodologii utilizate în diagnosticul genetic
CITOGENETICA -) Atunci când se suspectează clinic aberația citogenetică, cultivăm diferite tipuri de materiale biologice: lichid amniotic, vilozități corionice, măduvă osoasă, sânge periferic și țesuturi. Rezultatul procesării materialelor cultivate este un cariotip (set de cromozomi) al pacientului, care servește la excluderea oricărei aberații cromozomiale în diagnosticul diferențial.
PEȘTI - fluorescență in situ hibridizare
Separarea magnetică a celulelor patologice - folosind dispozitivul MACS, suntem capabili să separăm celulele plasmatice patologice de întreaga măduvă osoasă în mielom multiplu (MM) sau celule stem. Principiul constă în utilizarea caracteristicilor de pe suprafața celulelor, de ex. Se folosește selecția pozitivă Syndecan-1 și CD138 + în MM. Prin separare, obținem o populație de celule dintr-o linie. Celulele astfel obținute pot fi cultivate pe citogenetică sau se poate efectua hibridizare fluorescentă in situ direct pe ele. Avantajul este obținerea unei suspensii celulare cu o proporție mare de celule patologice, crescând sensibilitatea și specificitatea metodelor utilizate.
M (multicolor) -PESTE - este o tehnică care este utilă în identificarea rearanjărilor intercromozomiale mici și complexe și a așa-numitelor un marker al cromozomilor care nu pot fi detectați de citogenetica convențională.
mBAND (BAND multicolor) PEȘTE - tehnica este avantajoasă pentru determinarea fracturilor, analiza rearanjărilor intracromozomiale și poate fi utilă pentru preparatele cu cromozomi mai scurți.
DIAGNOSTIC MOLECULAR
arrayCGH - Metoda array-CGH (hibridizare genomică comparativă) este o tehnică cu cip. Oferă o abordare inovatoare pentru detectarea modificărilor dezechilibrate (ștergeri/duplicări) a căror localizare în genomul pacientului nu este cunoscută în prealabil. Metoda este de 100 de ori mai sensibilă decât cariotizarea și, prin urmare, mută diagnosticul citogenetic la nivel molecular.
- aCGH este un instrument adecvat de înaltă rezoluție pentru detectarea modificărilor submicroscopice ale genomului,
- aplicarea se găsește în diagnosticul prenatal și postnatal,
- contribuie la clarificarea diagnosticului, prevenirii, prognosticului, căutării unui tratament adecvat și oferă informații diagnostice pentru consiliere genetică prenatală,
- posibilitatea aplicării este, de asemenea, în cazurile în care cultivarea (amniocite) eșuează,
- permite rezolvarea descoperirilor neclare ale altor metode PCR (NGS, QF-PCR, MLPA).
Amplificare multiplexă a sondei (MLPA) - este o metodă bazată pe PCR cantitativ multiplex, care este utilizată pentru a detecta numărul relativ de copii ale secvențelor specifice. Folosind metoda MLPA, este posibil să se identifice o gamă largă de modificări genomice, în special ștergeri/duplicări mai extinse în gene sau cromozomi. În prezent, un număr mare de truse MLPA sunt disponibile pentru diagnosticarea diferitelor boli genetice. Este utilizat ca diagnostic de screening pentru sindroamele de microdelecție și a găsit, de asemenea, o utilizare enormă în tumorile maligne hematologice.
FIG. Analiza MLPA - detectarea trisomiei duble a cromozomilor X și 18.
QF-PCR (reacție în lanț cu polimerază fluorescentă cantitativă)
Metoda QF-PCR este potrivită pentru detectarea prenatală rapidă a celor mai frecvente aneuploidii (cromozomii 13, 18 și 21) și pentru detectarea sexului (X, Y) fără cultivarea prealabilă a celulelor fluidului amniotic (PV). Principiul metodei este propagarea secvențelor specifice de ADN (repetări scurte de tandem STR) folosind primerii marcați fluorescent. STR - markeri de repetare în tandem foarte polimorf, scurt, specifici fiecărui cromozom. Metoda QF-PCR se bazează pe compararea intensităților semnalelor fluorescente obținute prin propagarea ADN-ului STR al unei perechi de cromozomi specifici. Se determină raportul și numărul în care apar fiecare pereche și cromozomi sexuali în genomul fetal. Semnalul de fluorescență (vârf) arată alelele individuale ale individului. Prin compararea înălțimii (evaluând raportul ariei de vârf), obținem informații despre numărul de cromozomi. Avantajul QF-PCR este capacitatea de a detecta contaminarea maternă într-o probă PV și, de asemenea, de a demonstra paternitatea, designul uniparental și chiar de a determina zigozitatea gemenilor.
FIG. Electroforetetogramă multiplex QF-PCR a cromozomilor specifici
Monitorizarea nivelului genei de fuziune BCR-ABL: scopul este de a oferi diagnostice de calitate pentru monitorizarea răspunsului molecular profund al pacienților cu LMC (leucemie mielocitară cronică. Doar 2 laboratoare (Medirex as și NOU) din Slovacia au obținut un factor de conversie (CF), care este utilizat pentru raportarea la scară internațională.
Facem un diagnostic cuprinzător al pacienților cu LMC:
- Examinarea diagnosticului genei BCR-ABL prin PCR multiplex (determinarea a 8 tipuri de pauze BCR-ABL- (b2a2, b3a2, e1a2, c3a2, b1a1, b3a3, b2a3, a1a3).
- Monitorizarea moleculară a transcrierii BCR-ABL (acreditată).
- Detectarea mutațiilor în domeniul kinazei BCR-ABL.
Teste farmacogenomice: Testele farmacogenomice sunt utilizate pentru a testa sensibilitatea individuală la un tratament specific. Unele persoane pot avea nevoie de doze mai mari pentru a fi eficiente, în timp ce altele pot avea efecte secundare la dozele normale de medicament. Medirex oferă mai multe teste farmacogenomice de la 1 decembrie 2013 (5FU, CYP2D6, TPMT, IL-6).