Ca și la bărbați, hipogonadismul la femei poate fi împărțit în condiționat central (secundar) și primar. 
Sindromul ovarului polichistic acesta este Sindromul Stein-Leventhal este cauzată de diferite variații morfologice la nivelul ovarelor (ovarele sunt adesea mari, există multe chisturi la suprafață) și de activitatea lor hormonală patologică. Femeile afectate sunt infertile, au tulburări menstruale, obezitatea și hirsutismul sunt frecvente.
Hirzutism înseamnă păr excesiv al corpului cu o distribuție tipic masculină. În schimb, hipertricoza este părul crescut cu un tip de distribuție feminin, condiționat în majoritatea cazurilor rasial, constitutiv sau familial. Când hirsutismul este asociat cu pierderea caracteristicilor sexuale feminine secundare și predomină trăsăturile masculine (schimbarea formei, creșterea masei musculare, creșterea bărbilor, îngroșarea vocii), se vorbește despre virilizare.
Hirsutismul poate fi cauzat de boli ale glandelor suprarenale sau ale ovarelor. În majoritatea cazurilor, însă, cauza nu este identificată (hirsutism idiopatic). Hirsutismul idiopatic are un curs benign, de obicei nu este asociat cu o tulburare a ciclului menstrual și este mai mult o problemă psihologică și cosmetică.
La femei, funcția ovariană afectată și alte boli endocrine sunt de obicei prezente tulburare menstruală. Dacă o femeie nu a menstruat niciodată, aceasta este denumită primară amenoree. Are mai multe cauze și este întotdeauna necesar un examen profesional. Dacă menstruația se oprește mai mult de 3-4 luni, este amenoree secundară. Dacă sângerarea este mai mică de 6 ori pe an, se spune despre oligomenorei, se numește sângerare cu intervale mai mici de 21 de zile polimenoree. Se numește debutul sângerării menstruale menarché. Dacă menarhia este înainte de vârsta de 10 ani, se vorbește despre adolescența timpurie - praecox adolescent.
Interacțiunea hormonală este o condiție necesară ovulație. Chiar și la femeile sănătoase și cu menstruație normală, un anumit ciclu are loc fără ovulație (ciclu anovulator). Ovulația poate fi oprită în mod intenționat prin administrarea de steroizi contraceptivi. În condiții patologice, la așa-numitul Sindromul levental Stein nu provoacă ovulație. Cauza este acțiunea insuficientă a gonadotropinelor. Foliculii ovarieni se măresc la dimensiunea unui chist, dar nu se înmuguresc și nu are loc ovulația. Producția de androgeni ovarieni crește treptat. Femeia este infertilă și are părul crescut morbid (hirsutism).
Menopauza (punctul culminant) este un proces normal în care activitatea reproductivă și treptat hormonală a ovarelor încetează. Dacă apare înainte de vârsta de 40 de ani, se numește menopauză prematură.