Deși am avut succes în mod repetat în competiția internațională, nu am ratat fondurile de la Eurofunds, spune biochimistul Jozef Nosek într-un interviu.

Oamenii de știință slovaci au publicat în prestigioasa revistă Scientific Reports. Folosind o strategie experimentală elegantă, au dezvăluit rolul proteinelor de transport în membranele celulare. Proiectul a fost condus de Jozef Nosek și condus de echipa autorului Andrea Cillingová, ambii de la Facultatea de Științe, Universitatea Charles din Bratislava. În interviu, ei explică esența descoperirilor lor și, de asemenea, evaluează finanțarea științei în Slovacia.

Care este cercetarea ta?

Jozef Nosek (JN): Ne interesează biologia drojdiei. Într-unul dintre proiectele noastre, investigăm modul în care diferiții derivați hidroxi ai benzenului și ai acidului benzoic le afectează celulele. Aceste substanțe aromatice simple sunt foarte importante pentru industria chimică. Benzenul în sine este toxic și are efecte cancerigene. Pe de altă parte, acidul benzoic este utilizat în mod obișnuit ca conservant în industria alimentară, deoarece previne creșterea multor microorganisme, cum ar fi ciupercile. Unii dintre derivații săi s-au folosit în medicină (aspirină) și cosmetice (parabeni).

Cea mai mare sursă naturală de substanțe aromatice este lignina, care este unul dintre cei mai comuni polimeri organici din biosferă. Cu toate acestea, poluarea mediului prin compuși aromatici este cauzată în mare măsură de industrie. Nucleul benzenic al moleculelor aromatice este relativ stabil din punct de vedere chimic. Cu toate acestea, unele microorganisme îl pot descompune prin enzime și îl pot folosi ca sursă de carbon și energie pentru creșterea lor în reacțiile biochimice ulterioare. Astfel de microorganisme includ și unele tipuri de drojdie, de care ne ocupăm în laboratorul nostru. Cu toate acestea, nu se știa cum au făcut-o.

Jozef Nosek (1967)

a studiat genetica și biologia moleculară la Universitatea Comenius din Bratislava. A finalizat mai multe sejururi de cercetare la universitățile franceze. Astăzi este profesor de biochimie la Facultatea de Științe, Universitatea Charles. Din 2001 până în 2011, a lucrat ca cercetător internațional la Institutul Medical Howard Hughes din SUA. Împreună cu Ľubomír Tomášek, el a fondat laboratorul departamentelor de biochimie și genetică, în care studiază biologia drojdiei.

Ce ai descoperit?

JN: Am descoperit genele necesare pentru metabolismul compușilor aromatici din drojdie. De asemenea, am investigat asocierea reacțiilor biochimice relevante cu metabolismul central al celulelor eucariote (toate organismele multicelulare în sensul cel mai larg sunt alcătuite din celule eucariote. Sunt mai complexe structurate și de obicei mai mari decât celulele procariote), precum și modul în care celula controlează funcțiile genelor individuale. Ne întrebăm cum au apărut căile acestor reacții biochimice în evoluție.

bine
Colonii de drojdie patogenă Candida parapsiloză crescând într-o cutie Petri pe mediu hidroxibenzoat. Foto - arhivă Nosek și Cillingová

În cele mai recente lucrări din rapoarte științifice, am descoperit proteine ​​care transportă derivați hidroxi ai acidului benzoic prin membrana plasmatică în celulă, unde sunt utilizați în continuare. Deși astfel de proteine ​​au fost cunoscute de la bacterii, nu au fost găsite în celulele eucariote de mult timp. Am dezvoltat o strategie pentru a găsi două dintre sutele de proteine ​​de transport în celule care transportă hidroxibenzoați. Rezultatele cercetării noastre au adus noi cunoștințe biologice, dar arată, de asemenea, că drojdia poate fi utilizată pentru a elimina substanțele aromatice toxice din mediu.

Deși majoritatea coautorilor articolului sunt slovaci, ați condus o echipă internațională. Cum a fost coordonată o astfel de cooperare pentru dvs.?

JN: Cercetările noastre au necesitat cooperarea unor experți nu numai din diferite domenii ale științei (biochimie, genetică, genomică, microbiologie și informatică), ci și din diferite țări europene. Împreună cu Igor Zeman, Martina Neboháčová, Ľubomír Tomášek, doctoranzii noștri și studenții de la Facultatea de Științe, Universitatea Charles, experți din Ungaria, Polonia și Spania au participat, de asemenea, la cercetare.

Cooperarea internațională este în prezent esențială în cercetarea științifică. Permite nu numai schimbul de idei și experiențe, ci și schimbul de infrastructuri de cercetare și utilizarea eficientă a fondurilor, care sunt foarte limitate, în special în țara noastră. Ne cunoaștem cu colegii din străinătate de mult timp și cooperăm și la alte proiecte, astfel încât coordonarea muncii nu a fost problematică. Sunt foarte bucuros că mai mulți doctoranzi și studenți ai facultății noastre au contribuit semnificativ la rezultatele obținute. Pe lângă rezultatele științifice, proiectul nostru a contribuit și la educația tinerilor oameni de știință și a arătat că, în ciuda problemelor pe care le avem în Slovacia, știința bună se poate face și în țara noastră.

Sus: Aranjarea secvenței de aminoacizi a proteinei transportoare de hidroxibenzoat în membrana citoplasmatică a celulei. Stânga: Colonii de drojdie care cresc într-o cutie Petri pe mediu hidroxibenzoat. Dreapta: în celula de drojdie din figură, proteina transportoare de hidroxibenzoat a fost asociată cu o proteină fluorescentă care luminează verde (GFP) și celula a fost observată la microscopul de fluorescență. Experimentul arată că transportorul investigat este localizat în membrana citoplasmatică. Foto - arhivă Nosek și Cillingová

Primul autor al articolului este Andrea Cillingová, doctorandă la Departamentul de Biochimie. De ce ați decis să studiați la Facultatea de Științe, Universitatea Charles și nu ați plecat în străinătate?

Andrea Cillingová (AC): Principalul motiv pentru care să nu plec în străinătate a fost că nu am vrut să-mi părăsesc familia și prietenii pe care îi am în Slovacia. Am decis să studiez biologia și Facultatea de Științe, Universitatea Charles a fost cea mai bună alegere. După finalizarea masterului la Departamentul de Genetică, am decis să mă dedic lucrărilor științifice, așa că mi-am continuat studiile doctorale, de data aceasta la Departamentul de Biochimie, dar totuși în același laborator care acoperă ambele locuri de muncă. Munca științifică la ambele departamente este o dovadă că chiar și în Slovacia este posibil să se producă lucrări științifice de calitate, care să fie pe deplin competitive în comparație cu cele străine. Cu siguranță nu regret decizia mea de a rămâne în Slovacia.

Andrea Cilling (1988)

este doctorand la Universitatea Comenius din Bratislava. Lucrează în laboratorul comun al Departamentelor de Biochimie și Genetică, Facultatea de Științe, Universitatea Charles. În disertație, el examinează metabolismul substanțelor hidroxiaromatice din drojdie.

Ați solicitat o subvenție străină sau o subvenție finanțată de Eurofunds?

JN: De mai bine de zece ani, ne-am finanțat laboratorul în principal din două subvenții de la Institutul Medical Howard Hughes, una dintre cele mai prestigioase instituții biomedicale din Statele Unite.

În ceea ce privește Eurofunds, am făcut parte dintr-o echipă de cercetători de la SAS și două universități din Bratislava care au pregătit proiectul. Prin urmare, pot compara ambele experiențe. În cazul granturilor din SUA, proiectele includeau informații despre liderul echipei, rezultatele până în prezent și o propunere pentru un plan de cercetare, iar criteriile de evaluare erau clare și corecte. Pentru Eurofunds, intenția științifică a fost doar o parte neglijabilă a cererii și cea mai mare parte a „proiectului” trebuia să conțină o specificație detaliată a echipamentelor pe care intenționam să le cumpărăm în laboratoare.

În timp ce am avut succes în mod repetat în competiția internațională, nu am ratat fondurile din Eurofunds din cauza lipsei de fonduri alocate în cadrul apelului. Cu toate acestea, cu o administrație stupidă, am pierdut inutil mult timp prețios pe care l-am fi putut petrece cercetând sau educând studenții noștri.

În ultimii ani, ați criticat în mod repetat sistemul de învățământ și finanțarea științei în Slovacia. Cum privești această problemă în acest moment? Ce ai sugera să schimbi?

JN: Practic, tot ceea ce am criticat în trecut cu colegul meu Ľubomír Tomášek în revistele .týždeň (aici, aici și aici) și The Scientist nu s-a schimbat și este demn de criticat și astăzi. Simt chiar că situația este chiar mai gravă în acest moment decât am scris în acel moment.

Actualul caz cu distribuția Eurofunds către știință este paradoxal, mai ales că faptul că cei care l-au construit și folosit de ani buni protestează deja împotriva acestui sistem de distribuție financiară. Despre multe s-au scris în ultimele săptămâni, iar procurorii ar trebui să fie implicați mai intens în acuzare decât oamenii de știință înșiși. Cu toate acestea, nu voi ierta o comparație. Bugetul Ministerului Educației pentru acest an a alocat 780.000 de euro pentru toate echipele de top din universitățile noastre. În schimb, ministerul a planificat să distribuie aproape 600 de milioane de euro către companii ciudate pentru „cercetare strategică”.

Sistemul de finanțare a științei și cercetării din țara noastră este distorsionat, nu putem distinge calitatea de medie

O modalitate mai sensibilă de a împărți Eurofunds în știință a fost propusă recent de profesorul Ján Pišút (ministrul educației în anii 1990, ed. Note). Acesta constă în minimizarea influenței funcționarilor controlați de politicieni și în a începe să distribuie bani numai în funcție de calitatea grupurilor de cercetare. Acestea ar fi, de exemplu, astfel de grupuri care au trecut deja evaluarea Comisiei de acreditare sau au fost identificate în cadrul Academiei Slovace de Științe. O altă soluție poate fi creșterea bugetelor agențiilor de subvenționare VEGA (agenție de granturi științifice ale Ministerului Educației și Academiei Slovace de Științe, ed. Notă) și APVV (Agenție pentru Sprijinirea Cercetării și Dezvoltării), care joacă un rol cheie rol în finanțarea proiectelor științifice și a banilor europeni.ar putea începe finanțarea cercetării la nivel european.