1 Societatea Slovacă pentru Biochimie și Biologie Moleculară Institutul de Fiziologie Moleculară și Genetică SAS Institutul de Biochimie, Nutriție și Protecția Sănătății FCFT STU DROBNICOV MEMORIÁL Procesul din anul 4 Septembrie 2007 Kočovce ISBN

fost susținută

2 prof. Ing. Ľudovít DROBNICA, dr.

3 CUPRINS Amintiri ale prof. Ing. Ľudovít Drobnica, DrSc. 2 Comitetul de organizare 5 Secțiunea 5 Președintele Comisiei 5 Membrii Comisiei 5 Contact 5 Programul 6 Lista lucrărilor de afișare 11 Colecția de rezumate 13 Secțiunea I 13 Secțiunea II 31 Secțiunea III 45 Secțiunea IV 81 Secțiunea V 83 Post Secțiunea 99 Lista participanților 124 1

7 COMITETUL DE ORGANIZARE A SECȚIUNII Ing. Albert BREIER, dr. Dr. Dr. Zuzana KLIMESOVA Ing. Zdena SULOVA, CSc. doc. Ing. Ernest ŠTURDÍK, CSc. Ing. Dagmar ZBYŇOVSKÁ, CSc. I. Xenobiotice și relațiile dintre structura și efectul substanțelor II. Bioenergetica și biologia membranelor III. Biologie moleculară, celulară și microbiologie IV. Enzimologie V. Biotehnologie PREȘEDINTELE COMISIEI MEMBRII COMISIEI CONTACT prof. RNDr. Jaromir Pastorek, dr. Ing. Albert BREIER, dr. doc. RNDr. Miloslav GREKSAK, CSc. RNDr. Ivan HAPALA, CSc. doc. Olga KRIZANOVA, DrSc. RNDr. Karol ONDRIAS, dr. RNDr. Silvia PASTOREKOVA, dr. Ing. Zdena SULOVA, CSc. doc. Ing. Ernest ŠTURDÍK, CSc. Ing. Attila ZIEGELHÖFFER, dr. Institutul de Fiziologie Moleculară și Genetică SAS Vlárska 5, Bratislava 3 Tel.: 02/Fax: 02 /

12 21 septembrie 2007, vineri Mic dejun POST-SECȚIUNE Președinți: Silvia Pastoreková, Zdena Sulová, Ernest Šturdík Pauză Conferințe sponsor Prânz Ședința Comisiei Anunțarea rezultatelor Concursului Tinerilor Oameni de Știință 10

15 Colecția de rezumate Secțiunea I Xenobiotice și relațiile dintre structura și efectul substanțelor 13

17 R NH O O 1, NH 2-O-PS 2, NH 2-Prot 3, NaBH 4 O R = O-PS, Prot În prima etapă, a fost preparat un conjugat de glucan și O-PS. Acesta a fost purificat din amestecul de reacție prin cromatografie cu permeație pe gel și caracterizat prin spectroscopie 1H-RMN. O-PS legat de 14-48% din linkeri, rezultând 4,5-14% O-PS pe unitate monomer glucan. Următorul pas este legarea de proteine ​​(BSA). După purificare, conținutul de proteine ​​al conjugatului rezultat a fost determinat a fi de 12-22%. Concluzie A fost posibil să se pregătească un conjugat cu un număr mare de epitopi de carbohidrați pe un suport polizaharidic primar. Mai mult, proteina a fost legată cu succes, obținându-se astfel o construcție suplimentară de epitop de celule T. Materialele obținute așteaptă în prezent să fie utilizate în cercetarea ulterioară a proprietăților imunologice. 1. Activarea eficientă a polizaharidelor carboxil pentru prepararea conjugatelor, Pavol Farkaš și Slavomír Bystrický. Carb. Pol., 68, 2007,

21 mai mult de un metal prezent, evaluarea, interpretarea și afișarea datelor experimentale este mult mai complicată, așa că am înlocuit izotermele simple cu interpretarea utilizând suprafețe de sorbție 3D. Rezultatele obținute au demonstrat o afinitate mai mare a ionilor Zn 2+ pentru siturile de legare de pe suprafața lichenului și un efect competitiv reciproc între ionii Zn 2+ și Co 2+ în ocuparea siturilor de legare. Concluzie: Utilizarea metodelor grafice 3D pentru descrierea cantitativă a echilibrelor de concentrație a sorbției cationice metalice în experimentele de laborator face posibilă determinarea gradului de efect competitiv în prezența altor cationi prezenți în soluție într-o gamă largă de rapoarte de concentrație reciprocă. Această abordare va face, de asemenea, posibilă observarea unor astfel de efecte competitive care sunt pe punctul de a fi observabile atunci când se utilizează metode grafice 2D. Interpretarea rezultatelor folosind dependențe 3D este, de asemenea, potrivită pentru optimizarea experimentelor și o descriere mai detaliată a influenței mai multor variabile independente asupra proceselor de biosorbție în condiții dificile ale unui mediu natural poluat. Referințe Ho Y.S., Huang C.T., Huang H.W.: Process Biochem., 37 (2002) Lodeiro P., Cordero B., Barriada J.L., Herrero R., Sastre de Vincente M.E.: Bioresour. Tehn., 96 (2005) Loppi S., Frati L.: Environ. Monit. Asses., 114 (2006)

Undularea membranei bazale a epiteliului liniei germinale, dilatarea vaselor de sânge în interstițiu și apariția golurilor în epiteliul liniei germinale observate în testicule. Scăderea volumului relativ epitelial germinal, creșterea volumului interstițial relativ, precum și creșterea incidenței apoptozei au indicat leziuni interstițiale și au relevat apariția edemului. Valorile parametrilor măsurați de noi indică faptul că mercurul are un efect toxic asupra structurii generale a testiculelor și, astfel, asupra evoluției spermatogenezei la concentrațiile date. Munca noastră a confirmat efectele negative ale formei anorganice de mercur asupra parametrilor structurali și funcționali ai rinichilor și testiculelor. 23

27 a scăzut și activarea kinazei Akt în comparație cu inimile de control. Studiul MMP a arătat că în inimile de șobolan tratați cu L-NAME, activitățile atât ale țesutului, cât și ale serului, MMP-2 au fost scăzute. Pe de altă parte, în serul șobolanilor tratați cu L-NAME a crescut semnificativ activitatea gelatinolitică de aproximativ. S-a observat proteinaza de 20 kda. Se concluzionează că dezvoltarea NOD a dus la inhibarea căilor kinazei ERK și Akt și aceste modificări sugerează implicarea acestor cascade în răspunsurile miocardului la NOD. Rezultatele indică, de asemenea, relația posibilă între căile kinazei ERK și Akt și activarea enosului și/sau MMP-2. Mai mult decât atât, vulnerabilitatea redusă la leziuni ischemice la inimile cu șobolan deficitar poate fi legată de inhibarea expresiei inosului. Susținut de grantul VEGA 2/6170/27 și APVV

Se poate concluziona că quercetina are efecte antioxidante mai bune decât rutina datorită faptului că este oxidată preferențial față de rutină. Folosind metoda CV, amestecul ambilor antioxidanți a fost mai dificil de distins, ceea ce este evident din separarea vârfurilor aparținând componentelor individuale. Prin urmare, metoda DPV a fost preferată pentru măsurători ulterioare. Dependențele de calibrare de rutină și quercetină sunt prezentate în Figura 2. Figura 1: Compararea metodelor de măsurare a unui amestec de rutină și quercetină a.) CV de rutină 1,6 mg/l, quercetină 0,4 mg/l și b.) DPV de rutină 1.6 mg/l, quercetină 1,1 mg/l. Figura 2: Dependențe de calibrare măsurate prin metoda DPV quercetin la -0,04 V vs. SCE și rutină la 0,1 V vs. SCE. Concluzie: Folosind metode voltammetrice, a fost posibilă cartografierea proprietăților redox ale rutinei și quercetinei, în timp ce a fost dezvoltată o metodologie pentru determinarea lor cot la cot și aplicată analizei probelor reale. Această lucrare a fost creată cu sprijinul proiectului VEGA 1/4299/07 și cu un grant de la Universitatea Charles 17 /

33 Secțiunea II Bioenergetică și biologie membranară 31

45 de ioni Ca 2+. Minimul a fost cel mai pronunțat pentru raportul raportului [Li +]/[Ca 2+] și [Na +]/[Ca 2 12: 1. Când raportul de concentrație a fost mai mic, adâncimea minimului a scăzut. Nu am observat apariția anomaliilor în funcție de potențialul invers și conductivitatea din fracția molară a ionilor din amestecurile Ba 2+ -Ca 2+ sau Cs + -Ca 2+ pe partea luminală a canalului. Modelul de barieră a permeației ionice prin canalul ionic consideră prezența anomaliilor în funcție de potențialul invers și conductivitatea din fracția molară ca fiind o altă proprietate a canalelor multi-ionice, dar datorită absenței lor, numărul de ioni din calea conductivă nu poate fi judecat fără ambiguitate. Din punctul de vedere al modelului de barieră a permeabilității ionice, o proprietate mai semnificativă este dependența de concentrație a potențialului invers. Este considerat a fi una dintre caracteristicile care sunt asumate teoretic doar pentru canalele multi-ionice. Concluzie: Rezultatele noastre arată pentru prima dată că canalul RyR are, de asemenea, proprietățile de conductivitate ale canalelor multi-ion, ceea ce slăbește ipoteza acceptată până acum cu privire la caracterul unic ionic al acestui canal. 43

47 Secțiunea III Biologie moleculară, celulară și microbiologie 45

55 într-o măsură mai mică decât celulele S după cultivarea pe termen scurt și pe termen lung a celulelor cu cispt. Prin imunoprecipitare, am stabilit că în liniile MDR L1210 (R, V) cultivate în prezența cisptului, cantitatea de Bcl-2 predomină în complexele Bcl-2/Bax comparativ cu L1210 (S). Cantități crescute de proteină Bcl-2 (proteină antiapoptotică) legate în complex cu Bax (proteine ​​proapoptotice) au fost găsite în liniile MDR L1210 după cultivarea cu cispt. Raportul acestor proteine ​​joacă un rol important în reglarea apoptozei (2). De asemenea, am determinat nivelurile de proteine ​​Bcl-2 și Bax în fracțiuni solubile și de membrană, fără sau în prezența diferitelor concentrații de cisplatină. Concluzie: Am constatat prin testul MTT că celulele parentale L1210 care nu exprimă P-gp sunt mai puțin sensibile la creșterea concentrației de cisplatină, în schimb, procentul de celule apoptotice după incubarea cu cispt este semnificativ mai mare decât în ​​celulele rezistente. În același timp, am constatat, de asemenea, diferențe în nivelurile Bax și Bcl-2 în fracțiunile citosolice și membranare de la ambele tipuri de loci, precum și raporturi diferite ale ambelor proteine ​​din complexul Bcl-2/Bax, sugerând un răspuns apoptotic modificat în celulele care exprimă P-gp. Literatură: 1.-Lamming DW Jr: J. Undergrad. Știință. 3:, Basu și Haldar: Mol. Zumzet. Repr. 4:, Mulțumiri: Această lucrare a fost susținută de: apvt, vega-2/7122/7 și VEGA 2/080/26. 53

57 aranjament desemnat. Motivul aranjării specifice a inelului, precum și diferența principală față de homotrimerii PCNA, este prezența a trei interfețe unice care diferă unele de altele prin proprietăți fizico-chimice. Cea mai mare interfață cu cea mai mare complementaritate, număr de legături de hidrogen și interacțiuni de încărcare este între subunitățile PCNA1-PCNA2, ceea ce explică cel mai mic K D (10-11 M) măsurat pentru aceste două proteine ​​[4], precum și aranjamentul inelar. Structura dimerului PCNA12 este în formă de V. Comparația dimerului PCNA12 cu PCNA12 din heterotrimer a arătat o curbură diferită a dimerului PCNA12, precum și modificări structurale în interfețele PCNA2-PCNA3 și PCNA1-PCNA3, sugerând că în timpul PCNA123 formarea heterotrimerului în celula dimerului PCNA12 se modifică. Referințe: 1. Maga, G. și U. Hubscher. J. Cell Sci., P Warbrick, E. Bioessays, (11): p Krishna TS, Fenyo D, Kong XP, Gary S, Chait BT, Burgers P, Kuriyan J. J. Mol Biol 12 august; 241. p Dionne I, Nookala RK, Jackson SP, Doherty AJ, Bell SD. Mol. Cell, p Mulțumiri: Această lucrare a fost susținută de o subvenție OIM CIHR. Participarea la Memorialul Drobnice din 2007 a fost susținută de o subvenție Vega 1/4360/07. 55

79 (2 tulpini de S. agalactiae) au avut dimensiuni de 1095 și 1347 bp. Secvențierea și analizele ulterioare BLAST au dezvăluit relația lor cu familia de proteine ​​alfa. Pe baza acestui studiu, s-a constatat o mare variabilitate în organizarea genelor individuale de tip alfa. Datorită variabilității și dependenței lor de apariția geografică, aceste gene pot să nu fie utile pentru detectarea S. agalactiae, dar sunt dovezi ale variabilității biologice în cadrul acestei familii de proteine. Prezența genei care codifică proteina Sip a fost detectată prin screening PCR multiplex al unei colecții de 75 de izolate de S. agalactiae bovine. Pentru a compara variabilitatea posibilă în secvența nucleotidică a genei sip, au fost proiectați și utilizați primerii frontali din cadrul genei și un primer universal invers în amestecul de reacție multiplex PCR. Această metodă a dovedit identitatea ridicată a genei sip, precum și specificitatea acesteia pentru S. agalactiae. Concluzie: Rezultatele acestei lucrări au confirmat variabilitatea semnificativă a proteinelor de suprafață S. agalactiae, cu toate acestea, gena sip a fost specifică pentru S. agalactiae și, prin urmare, este utilă pentru detectarea acestui agent patogen. 77

81 și prin screening-ul acestor familii cu această tehnică, am putea confirma în mod clar diagnosticul de HNPCC. Rezultate și discuții: Până acum am reușit să identificăm primele 5 modificări diferite ale genei lungi folosind tehnica MLPA (ștergerea exonului 1-7 în gena hmsh2 la doi indivizi fără legătură, ștergerea exonului 1-3 în gena hmsh2, ștergerea a exonului 1 în gena hmsh2, duplicarea exonilor 5-6 în gena hmsh2 și ștergerea exonilor 5-6 în gena hmh2) la 6 pacienți HNPCC fără legătură. Rezultatele obținute indică faptul că chiar și în populația noastră, modificările lungi ale genelor pot contribui semnificativ la formarea HNPCC. Concluzie: Identificarea acestor noi tipuri de mutații germinale la pacienții suspiciți HNPCC este importantă și pentru rudele la care am testat prezența unei modificări lungi date pentru a selecta un grup de purtători de mutație și a le include într-un program special de prevenire. În prezent lucrăm la identificarea site-urilor în care a avut loc o pauză și o anumită parte a genei a fost pierdută. După introducerea cu succes a tehnicii la locul nostru de muncă, am contribuit la stabilirea tehnicii menționate pentru dovada modificărilor genice lungi în genele BRCA1/2, de asemenea, la Departamentul de Genetică Clinică al Institutului de Oncologie Sf. Elisabeta. 79

83 Secțiunea IV Enzimologie 81

84 Memorialul Drobnicov, anul 4, septembrie 2007, Kočovce 82

85 Secțiunea V Biotehnologie 83

101 Poster secțiunea 99

103 Rezultatele confirmă regula generală conform căreia accesibilitatea potențială a metalelor grele la plante este invers legată de valoarea reacției solului și este afectată semnificativ de schimbul reacției solului (ph/kcl). 101

109 (XG, HEC) în cazul XTH din tulpini de nasturți sau din rădăcini și semințe de pătrunjel sunt dependente de prezența XGO în contrast cu XTH din semințe de nasturți, care hidrolizează XG în absența XGO (Farkaš și colab., 1992 ). XTH-urile izolate din semințe au aproape aceleași activități de degradare a polimerilor pe acești doi donatori la concentrații mai mari de XGO. Concluzie: Diferențele în punctele izoelectrice (pi) și specificitatea substratului probelor studiate izolate din diferite părți de pătrunjel și nasturțium ar oferi informații despre zona de cercetare care nu a fost încă explorată. Această cercetare a fost susținută de Agenția de Granturi Slovacă VEGA Nr. 2/6133/26 și prin subvenția nr. II/2/2005 de la Academia de Științe Slovacă la Centrul de Excelență GLYCOBIOS. Referințe: Ait Mohand F și Farkas V. Carbohydr. Rez. 341, 2006, Farkas V., Ait-Mohand F., Stratilova E. Plant Physiol. Biochimie. 43, 2005, Farkas V., Sulova Z., Stratilova E., Hanna R., Maclachlan G. Arch. Biochimie. Biofizi. 298, 1992, Fry S.C., Smith R.C., Renwick K.F., Martin D.J., Hodge S.K., Mathews K.J. Biochimie. J. 282, 1992, Iannetta P.M. și Fry S.C Phytochem. Anal. 10, 1999, Nishitani K. Int. Rev. Citol. 173, 1997, Sulová Z., Lednická M., Farkaš V. Anal. Biochimie. 229, 1995,

117 analiza produsului final. Odată cu creșterea adaosului de suc de usturoi resp. usturoiul granulat a redus volumul și bolta produselor. Pentru a îmbunătăți calitatea generală a produselor, a fost testată adecvarea aplicării acidului ascorbic ca ameliorator de panificație. Concluzie: Rezultatele au arătat că cele mai acceptabile produse pentru evaluatori au fost 0,5 și 1% adăugarea de suc de usturoi și adăugarea de acid ascorbic. Mulțumiri: Lucrarea a fost susținută de subvenții: APVT (), AV (4/0013/07) și APVV (031006). FIG. 1 Influența diferitelor concentrații de suc de usturoi pe parcursul curbelor farinografice 115

128 KOČOVCE Conacul și parcul sunt folosite de Facultatea de Inginerie Civilă a Universității Slovace de Tehnologie din Bratislava din 1967 și servesc drept unitate de instruire în clasă, cu posibilitatea organizării de conferințe, seminarii, predării studenților.