Heydrich a fost protectorul adjunct imperial al Protectoratului Boemiei și Moraviei. Acest apropiat al șefului SS Heinrich Himmler a fost, de asemenea, unul dintre cei mai mari organizatori ai Holocaustului. În ianuarie 1942, a condus o conferință la Wannsee, unde s-a decis exterminarea a milioane de evrei în lagărele de concentrare Majdanek, Auschwitz, Treblinka etc. Era un favorit. Istoricii îl consideră una dintre cele mai întunecate figuri ale nazismului. A venit în Boemia în 1941 cu scopul clar de a-i face pe cehi germani. Prin urmare, el a avut o descriere detaliată a compoziției rasiale a locuitorilor protectoratului. „Trebuie să mi se ofere oportunitatea, prin diferite metode, prin diferite mijloace, de a evalua întreaga populație în termeni de rasă și naționalitate. Fie cu ajutorul razelor X, spectacolelor școlare, fie prin testarea rasială a tinerilor ", a spus el când a preluat funcția.
În plus, mai mulți istorici de război sunt de acord că Heydrich urma să stabilească ordinea în Republica Cehă. Prin urmare, a executat mai mulți generali cehi, ceea ce a supărat guvernul aflat în exil la Londra. Acesta a fost aparent declanșatorul pregătirilor pentru asasinat.
Operațiunea Anthropoid, așa cum s-a numit asasinarea lui Hedrich, a fost de a împiedica Heydrich să se adreseze zelos Holocaustului și germanizării Protectoratului. Prin urmare, în Marea Britanie a fost creată o unitate specială, al cărei scop era asasinarea urâtului nazist. Asasinatul a avut loc la 27 mai 1942 la Praga. Heydrich a murit din cauza rănilor sale pe 4 iulie. După moartea sa, naziștii au șters satele Lidice și Ležáky de pe harta lumii ca răzbunare.
Cu toate acestea, mai mulți istorici consideră asasinarea pozitivă, deoarece susțin că tatăl Holocaustului a murit. „Reinhard Heydrich a fost unul dintre cei mai mulți ucigași în masă din istoria omenirii, dacă nu chiar cel mai masiv”, a declarat pentru Mladá fronta Dnes istoricul militar Michal Burian. Potrivit unui alt istoric, Jan Boris Uhlíř, consecințele asasinării populației civile au fost atât de cumplite, deoarece cehii erau extrem de importanți pentru ei și aveau nevoie să mențină ordinea în ei: nu s-a întâmplat. "